1882 Yılında Muğlada doğan Mustafa Muğlalı 1900 yılında Kara Harp Okulu’ndan mezun oldu. 1901 yılında Orduda görev almaya başladı. 1951 yılına kadar orduda görev yaptı. 1912–1913 yıllarında Balkan Savaşı’nda, 1914–1918 yıllarında Birinci Dünya Savaşı’nda savaştı. Kurtuluş Savaşı’nda, Kuva-yı Milliye’ye bağlı olup sonradan adı Yavuz Grubu olarak değişen Zabitân Grubu’nun komutanlığını yaptı. Menemen olayı sonrası kurulan Divan-ı Harp Mahkemesi’ne başkanlık etti.Muğlalı, Makbule Muğlalı(ö.1964) ile evli ve Leman ile Neşe adlarında iki kız çocuğu babasıydı.